En al temporada 1989-1990 el resultado obtenido en grupo IV de la Tercera división sería el trece, y en la 1990-1991 sería el diez. En la 1991-1992 el puesto obtenido sería el Ocho , destacando que en estas tres temporadas existían dos grupos dentro de la Tercera División Valenciana Norte y Sur, por lo que en esta ultima temporada se hacía una restructuracion a un solo grupo , por lo cual el Club descendía a la Regional Preferente. En 1992-1993 y ya en la Preferente el club obtenía un décimo puesto y en la 1993-1994 el puesto obtenido sería el octavo. A lo largo de la temporada 1994-1995 el club celebra el 75 Aniversario haciendo distintos actos a lo largo de la temporada así como la remodelación de varias partes del Fornás como la Tribuna, Vestuarios, Sala de juntas, despachos etc. En esa temporada el Club queda campeón de la Preferente subiendo de nuevo a la Tercera División. En la temporada 1995-1996 El resultado obtenido es buenísimo quedando subcampeón de la Tercera División por detrás del Lliria y promocionando por tercera vez en la historia a la Segunda División Nacional B arrebatado por el Real Murcia En 1996-1997 el resultado obtenido es el décimo, y en la 1997-1998 de nuevo se desciende a la Preferente al haber obtenido el penúltimo puesto.

 En la 1998-1999 de Nuevo en Preferente se queda segunda por detrás del Levante B, arrebantandole el ascenso en la promoción el Carcagente. Algunos jugadores de esta época són: Blas, Miguel Angel, Carlos Conesa, Hurtado, Olivares, Dani, Guzman, Jorge Herrero, Vladi, Jose Mari Mas, Sergio Villalba, Guerra, LLorens, Davis Campos, Sanchis, Torres Mestre, Rifaterra, Stefan, Edu, Alvaro, Miguelin, Picón, Diego, Ruben Benito, Alvaro, Alcolea, Quique